38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0955 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 
911 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 
911 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 
912 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 
896 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  42.86 
 
 
946 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  38.1 
 
 
927 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  38.98 
 
 
948 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  38.98 
 
 
947 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  46.03 
 
 
937 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  55.81 
 
 
1057 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  55.32 
 
 
1408 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  51.06 
 
 
945 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  33.96 
 
 
1245 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 
883 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  37.5 
 
 
931 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  44.07 
 
 
1097 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  44.44 
 
 
1147 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  44.44 
 
 
1148 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  44.44 
 
 
1149 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  44.44 
 
 
1143 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  42.37 
 
 
1129 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  48.94 
 
 
1761 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  42.86 
 
 
1124 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  42.86 
 
 
1115 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  51.06 
 
 
957 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  38.71 
 
 
731 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  38.71 
 
 
722 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  48.94 
 
 
895 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  41.27 
 
 
1110 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  32.1 
 
 
828 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  48.94 
 
 
1135 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  45.45 
 
 
1359 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  43.14 
 
 
806 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  44 
 
 
924 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  44 
 
 
914 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  38.46 
 
 
822 aa  42.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>