More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0866 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  99.4 
 
 
331 aa  679    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  100 
 
 
331 aa  682    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 
354 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  37.31 
 
 
341 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  39.41 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  39.03 
 
 
337 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  39.03 
 
 
337 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 
402 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  36.98 
 
 
383 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 
354 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  32.61 
 
 
374 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  32.91 
 
 
334 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.71 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  34.94 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  34.67 
 
 
366 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 
366 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 
375 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 
368 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  32.73 
 
 
407 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  33.85 
 
 
413 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  34.29 
 
 
391 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  32.32 
 
 
390 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  32.41 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
347 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  32.36 
 
 
387 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
401 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 
351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
352 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
352 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
352 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
352 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 
351 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  30.05 
 
 
423 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 
380 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 
411 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  32.42 
 
 
390 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  32.58 
 
 
344 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  32.42 
 
 
394 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 
351 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  32.42 
 
 
390 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  34.36 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
356 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  32.18 
 
 
406 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 
404 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 
351 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
364 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 
349 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  29.67 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  32.15 
 
 
355 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  31.02 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 
352 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  32.83 
 
 
371 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  32.36 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  31.85 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  31.49 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  31.49 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.78 
 
 
413 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  31.2 
 
 
390 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  32.93 
 
 
390 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  33.75 
 
 
355 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  34.24 
 
 
380 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  32.7 
 
 
342 aa  159  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 
348 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.21 
 
 
387 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  30.81 
 
 
391 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.52 
 
 
387 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 
349 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 
383 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  31.21 
 
 
387 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 
400 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 
395 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 
414 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 
328 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
348 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  36.05 
 
 
348 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  32.62 
 
 
349 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  32.4 
 
 
333 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  30.18 
 
 
390 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  30.18 
 
 
390 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  31.51 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>