More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0564 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  46.85 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  43.59 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  43.09 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  43.93 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  42.5 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  45.76 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  38.79 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  42.24 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1092  ribosome-binding factor A  41.38 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  39.64 
 
 		 124 aa  87.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  42.5 
 
 		 121 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2427  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224227  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  40.83 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2991  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0708502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2748  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131099  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  38.14 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2135  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0168697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  37.01 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3382  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0271741  normal  0.693723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2010  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142179  normal  0.57147 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2749  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>