More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0471 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  534  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.22 
 
 
258 aa  527  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
261 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
256 aa  299  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.72 
 
 
257 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
254 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  53.17 
 
 
257 aa  284  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  53.17 
 
 
257 aa  284  1e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
257 aa  283  2e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
252 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
254 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
250 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
249 aa  245  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
250 aa  245  5e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
251 aa  242  4e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
254 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.34 
 
 
250 aa  238  6e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
269 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  47.62 
 
 
249 aa  234  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  47.62 
 
 
249 aa  234  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
251 aa  233  2e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  46.89 
 
 
252 aa  232  4e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.53 
 
 
248 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.42813e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.9 
 
 
253 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.53 
 
 
248 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.55142e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.31 
 
 
249 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  43.9 
 
 
249 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  43.5 
 
 
249 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.53 
 
 
248 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.80953e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.72 
 
 
248 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.72 
 
 
248 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.72 
 
 
248 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.72 
 
 
248 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  45.12 
 
 
248 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.75994e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  45.12 
 
 
248 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.65743e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
248 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.49507e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.12 
 
 
248 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.24318e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.72 
 
 
248 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
253 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
253 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.12 
 
 
248 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.77661e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  46.34 
 
 
249 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.12 
 
 
248 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.49919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
251 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
248 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
261 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  43.03 
 
 
248 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  43.5 
 
 
249 aa  221  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
253 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
248 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
250 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
248 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
254 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  7.97066e-07  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
248 aa  216  3e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
250 aa  216  3e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
248 aa  216  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.94 
 
 
254 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.98 
 
 
249 aa  215  6e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.15 
 
 
249 aa  215  7e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.22 
 
 
248 aa  214  1e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
254 aa  214  1e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  44.08 
 
 
248 aa  214  1e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.21 
 
 
254 aa  214  1e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
248 aa  213  2e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
248 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
248 aa  212  4e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.74 
 
 
249 aa  212  5e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
252 aa  212  5e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  41.98 
 
 
253 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
248 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
254 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
248 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  42.37 
 
 
268 aa  209  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
271 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
255 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.55421e-10  hitchhiker  1.59857e-12 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.33 
 
 
254 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  3.85865e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
254 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  2.61149e-11  unclonable  5.03217e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
248 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  41.15 
 
 
253 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.42595e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  41.8 
 
 
253 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
267 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  42.15 
 
 
255 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  43.67 
 
 
262 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  3.09791e-05  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  40.41 
 
 
250 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
256 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
257 aa  200  2e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0971  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.13 
 
 
248 aa  200  2e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  38.78 
 
 
251 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
250 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  41.08 
 
 
250 aa  198  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
256 aa  197  1e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>