More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0097 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02891  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
752 aa  967    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0681  DNA topoisomerase IV, A subunit  62.28 
 
 
752 aa  968    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00876  DNA topoisomerase IV subunit A  62.2 
 
 
762 aa  972    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4330  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
752 aa  968    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4912  DNA topoisomerase IV subunit A  63.69 
 
 
752 aa  1005    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3556  DNA topoisomerase IV subunit A  60.68 
 
 
755 aa  954    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0821  DNA topoisomerase IV subunit A  63.18 
 
 
744 aa  966    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.508996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4965  DNA topoisomerase IV subunit A  63.55 
 
 
752 aa  1006    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414815  normal  0.944414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5693  DNA topoisomerase IV subunit A  64.09 
 
 
754 aa  1014    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4171  DNA topoisomerase IV subunit A  61.38 
 
 
769 aa  978    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1229  DNA topoisomerase IV, A subunit  57.05 
 
 
758 aa  865    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3897  DNA topoisomerase IV subunit A  60.41 
 
 
758 aa  959    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3487  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
752 aa  968    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4960  DNA topoisomerase IV, A subunit  63.11 
 
 
751 aa  1002    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2836  DNA topoisomerase IV subunit A  60.93 
 
 
765 aa  957    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0133106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3430  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 
752 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0705  DNA topoisomerase IV subunit A  58.13 
 
 
749 aa  885    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.965779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3456  DNA topoisomerase IV subunit A  62.01 
 
 
752 aa  966    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3051  DNA topoisomerase IV subunit A  63.14 
 
 
751 aa  1009    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00492  DNA topoisomerase IV subunit A  61.76 
 
 
761 aa  993    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2908  DNA topoisomerase IV subunit A  63.14 
 
 
751 aa  1009    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0554  DNA topoisomerase IV subunit A  63.11 
 
 
751 aa  998    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2194  DNA topoisomerase IV subunit A  54.82 
 
 
762 aa  857    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1868  DNA topoisomerase IV subunit A  54.74 
 
 
772 aa  847    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.198305  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3355  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 
752 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01152  DNA topoisomerase IV subunit A  59.55 
 
 
747 aa  905    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.335625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3525  DNA topoisomerase IV subunit A  62.42 
 
 
752 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2282  DNA topoisomerase IV subunit A  60.72 
 
 
747 aa  960    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0503  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
754 aa  975    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668096  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0662  DNA topoisomerase IV subunit A  61.87 
 
 
757 aa  971    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0820  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3427  DNA topoisomerase IV subunit A  61.47 
 
 
752 aa  959    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2119  DNA topoisomerase IV subunit A  65.9 
 
 
749 aa  1043    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0384  DNA topoisomerase IV subunit A  59.14 
 
 
742 aa  912    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.4801  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0788  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  950    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0813  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00825768  unclonable  0.00000000000743821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2669  DNA topoisomerase IV subunit A  62.33 
 
 
756 aa  975    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00978716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3611  DNA topoisomerase IV subunit A  61.79 
 
 
757 aa  952    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4788  DNA topoisomerase IV subunit A  63.69 
 
 
752 aa  1005    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172576  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02841  hypothetical protein  62.28 
 
 
752 aa  967    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2007  DNA topoisomerase IV subunit A  62.74 
 
 
761 aa  987    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000513735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0276  DNA topoisomerase IV subunit A  61.87 
 
 
757 aa  971    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3197  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
752 aa  968    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0624  DNA topoisomerase IV subunit A  58.4 
 
 
749 aa  887    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.166462  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3424  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 
752 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0398  DNA topoisomerase IV subunit A  63.72 
 
 
748 aa  988    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.170842  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2069  DNA topoisomerase IV subunit A  99.87 
 
 
751 aa  1539    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.337992  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004516  topoisomerase IV subunit A  62.47 
 
 
761 aa  956    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3218  DNA topoisomerase IV subunit A  58.81 
 
 
770 aa  947    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000131393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0332  DNA topoisomerase IV subunit A  62.62 
 
 
756 aa  974    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0678  DNA topoisomerase IV subunit A  62.28 
 
 
752 aa  968    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2543  DNA topoisomerase IV subunit A  60.73 
 
 
750 aa  923    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.644539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3310  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 
752 aa  965    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.31337  normal  0.0249309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2157  DNA topoisomerase IV subunit A  53.49 
 
 
771 aa  833    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0532  DNA topoisomerase IV, A subunit  62.53 
 
 
753 aa  986    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4704  DNA topoisomerase IV subunit A  63.96 
 
 
752 aa  1001    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0459341  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0551  DNA topoisomerase IV subunit A  60 
 
 
755 aa  952    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.243647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0509  DNA topoisomerase IV subunit A  62.08 
 
 
770 aa  996    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0256564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1284  DNA topoisomerase IV subunit A  58.61 
 
 
747 aa  912    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.344105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4259  DNA topoisomerase IV subunit A  63.01 
 
 
757 aa  987    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0097  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
753 aa  1545    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0581  DNA topoisomerase IV subunit A  61.87 
 
 
757 aa  971    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0598  DNA topoisomerase IV subunit A  59.65 
 
 
748 aa  931    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3229  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  955    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308276  hitchhiker  0.00000104584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0760  DNA topoisomerase IV subunit A  60.41 
 
 
758 aa  959    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000176508  hitchhiker  0.000384716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  60.89 
 
 
750 aa  925    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0969  DNA topoisomerase IV subunit A  65.28 
 
 
749 aa  1019    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139272  normal  0.119804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3325  DNA topoisomerase IV subunit A  62.06 
 
 
767 aa  972    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.846721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4188  DNA topoisomerase IV subunit A  59.59 
 
 
758 aa  946    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0339  DNA topoisomerase IV subunit A  61.94 
 
 
756 aa  965    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43460  DNA topoisomerase IV subunit A  65.07 
 
 
752 aa  1030    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0560657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65605  DNA topoisomerase IV subunit A  64.35 
 
 
754 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0554373  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3571  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  950    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0073811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0781  DNA topoisomerase IV subunit A  59.59 
 
 
757 aa  952    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.255419  hitchhiker  0.00000939983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0775  DNA topoisomerase IV subunit A  59.86 
 
 
758 aa  957    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0849191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0732  DNA topoisomerase IV subunit A  60.27 
 
 
758 aa  958    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207588  decreased coverage  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3360  DNA topoisomerase IV subunit A  62.14 
 
 
752 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.384916  normal  0.452559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3769  DNA topoisomerase IV subunit A  61.47 
 
 
758 aa  961    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.874978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3041  DNA topoisomerase IV subunit A  60.95 
 
 
756 aa  964    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0864  DNA topoisomerase IV subunit A  60.22 
 
 
759 aa  972    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0601  DNA topoisomerase IV subunit A  63.82 
 
 
749 aa  1008    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2787  DNA topoisomerase IV subunit A  64.86 
 
 
768 aa  1007    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2931  DNA topoisomerase IV subunit A  46.27 
 
 
814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0901  DNA topoisomerase IV subunit A  44.3 
 
 
793 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0940  DNA topoisomerase IV subunit A  43.9 
 
 
791 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3163  DNA topoisomerase IV subunit A  43.83 
 
 
784 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.960241  normal  0.258195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2123  DNA topoisomerase IV subunit A  44.59 
 
 
773 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1611  DNA topoisomerase IV subunit A  41.7 
 
 
754 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1016  DNA topoisomerase IV subunit A  41.4 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969284  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0930  DNA topoisomerase IV subunit A  41.4 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0785421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5698  DNA topoisomerase IV subunit A  42.59 
 
 
773 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493333  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2558  DNA topoisomerase IV subunit A  42.01 
 
 
769 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0978  DNA topoisomerase IV subunit A  43.72 
 
 
781 aa  558  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1850  DNA topoisomerase IV subunit A  42.97 
 
 
805 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000934072  normal  0.0141672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2356  DNA topoisomerase IV subunit A  41.08 
 
 
780 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5083  DNA topoisomerase IV subunit A  39.75 
 
 
795 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.79366  normal  0.0431885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2380  DNA topoisomerase IV subunit A  42.59 
 
 
773 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0920  DNA topoisomerase IV subunit A  42.82 
 
 
773 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0345239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2359  DNA topoisomerase IV subunit A  42.48 
 
 
773 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1201  DNA topoisomerase IV subunit A  40.69 
 
 
784 aa  558  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.955209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>