More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0093 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1264  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  52.23 
 
 
721 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00386395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1021  hypothetical protein  56.38 
 
 
718 aa  815    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0988  hypothetical protein  56.24 
 
 
718 aa  813    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1224  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 
734 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461762  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1671  oligopeptide ABC transporter periplasmic component  53.52 
 
 
713 aa  756    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.142506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1768  extracellular solute-binding protein  54.88 
 
 
749 aa  797    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0093  oligopeptide-binding protein  100 
 
 
744 aa  1523    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.386924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1182  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
709 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.256161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2334  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 
755 aa  809    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2642  extracellular solute-binding protein family 5  50 
 
 
775 aa  708    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2033  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 
741 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.240451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1750  putative extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 
758 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  28.99 
 
 
586 aa  230  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  28.99 
 
 
586 aa  230  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3695  putative binding protein component of ABC transporter  26.72 
 
 
600 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
544 aa  127  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 
594 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 
534 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 
544 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.71 
 
 
535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.34 
 
 
540 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.13 
 
 
540 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
540 aa  107  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.33 
 
 
532 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 
544 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
532 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
545 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.47 
 
 
544 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
544 aa  100  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.1 
 
 
520 aa  99.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
536 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 
531 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
538 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.85 
 
 
545 aa  99  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
532 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.34 
 
 
505 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
530 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 
589 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.18 
 
 
526 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
532 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.54 
 
 
565 aa  94.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.12 
 
 
521 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
521 aa  94  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.88 
 
 
521 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.88 
 
 
521 aa  94  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.88 
 
 
521 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 
543 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
531 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
586 aa  93.6  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.12 
 
 
524 aa  94  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
531 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
538 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
545 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.27 
 
 
528 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 
622 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
536 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  23.15 
 
 
532 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
535 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
528 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 
505 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.2 
 
 
528 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
547 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.81 
 
 
586 aa  88.2  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
560 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  22.78 
 
 
528 aa  87.8  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
542 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
528 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.94 
 
 
539 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 
531 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  22.41 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
531 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.51 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.51 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.51 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
535 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  23.21 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.51 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.51 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 
533 aa  85.1  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.04 
 
 
546 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  24.78 
 
 
531 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
531 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>