20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0085 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.87 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  31.54 
 
 
191 aa  63.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  28.69 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  36.71 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  29.69 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  27.87 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  28.23 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  41.07 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
386 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  28.4 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  26.56 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  29.69 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  34.78 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  36.23 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  27.07 
 
 
631 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  20.28 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  23.39 
 
 
151 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.07 
 
 
165 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>