66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0066 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
418 aa  863    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  99.28 
 
 
418 aa  853    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  48.97 
 
 
424 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  36.88 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  35.61 
 
 
437 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.68 
 
 
437 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  36.49 
 
 
449 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
449 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  36.32 
 
 
437 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  34.95 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  34.65 
 
 
429 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  34.64 
 
 
441 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  31.11 
 
 
430 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  32.08 
 
 
428 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  32.18 
 
 
438 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.57 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  32.74 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  32.48 
 
 
438 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  30.09 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  31.79 
 
 
441 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.65 
 
 
443 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 
450 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  30.81 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  26.04 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  27.13 
 
 
446 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  28.1 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  27.67 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  28.88 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
396 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  27.44 
 
 
452 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  28 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  27.79 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  27.11 
 
 
446 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  28.67 
 
 
452 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  29.24 
 
 
455 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  27.11 
 
 
446 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  28.32 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  27.59 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  27.35 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  28.57 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  29.29 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
453 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  23.33 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  22.86 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  25.82 
 
 
456 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  30.28 
 
 
436 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  30.94 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  29.58 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  23.31 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  29.79 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  28.26 
 
 
452 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  28.47 
 
 
443 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  29.63 
 
 
436 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  28.26 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  25.9 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  26.28 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  26.62 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  26.95 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  28 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  29.08 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  27.46 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  44.58 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  27.34 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  26.15 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  27.74 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  29.29 
 
 
443 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>