82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13528 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  337  5.9999999999999996e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  69.87 
 
 
178 aa  230  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  57.76 
 
 
188 aa  199  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.6 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.62 
 
 
167 aa  190  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.22 
 
 
163 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  50.31 
 
 
173 aa  175  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  51.57 
 
 
166 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  50.93 
 
 
163 aa  174  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.78 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.4 
 
 
170 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  33.08 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.94 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.49 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.2 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  27.5 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  29.37 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  29.37 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  28.48 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  27.94 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.05 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  26.8 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.65 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.32 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.79 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.33 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.33 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.1 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  25.93 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  29.29 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  27.63 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  27.81 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  29.93 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.23 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  27.41 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  24.68 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  26.32 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.54 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.16 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.36 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  26.06 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  26.06 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  26.32 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  26.75 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.61 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.34 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  28.07 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.07 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  28.87 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.88 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  28.15 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.22 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.38 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  23.49 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  30.25 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  30.25 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  30.25 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.31 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.48 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.99 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  21.2 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  26.98 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.36 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.15 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.15 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.1 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  25.99 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  27.27 
 
 
155 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.6 
 
 
163 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  26.39 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  23.95 
 
 
163 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.01 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.24 
 
 
182 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>