90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13428 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  100 
 
 		 1634 aa  3148    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  46.04 
 
 		 3089 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.01 
 
 		 2344 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 2588 aa  185  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.53 
 
 		 2487 aa  131  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  28.24 
 
 		 5442 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  39.19 
 
 		 860 aa  106  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  39.19 
 
 		 2364 aa  106  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  46.24 
 
 		 766 aa  99.8  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.09 
 
 		 4071 aa  99.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  42.86 
 
 		 774 aa  97.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.87 
 
 		 2833 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  47.87 
 
 		 726 aa  96.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  45.05 
 
 		 1097 aa  95.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  42.11 
 
 		 3958 aa  89  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  48.89 
 
 		 873 aa  87.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  42.11 
 
 		 4044 aa  82.4  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35.05 
 
 		 6497 aa  80.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.54 
 
 		 2239 aa  81.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  36.13 
 
 		 5298 aa  79  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35 
 
 		 1526 aa  67  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  35.82 
 
 		 2262 aa  67  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35.96 
 
 		 3227 aa  65.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  30.71 
 
 		 871 aa  63.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  28.21 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1243 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  24.01 
 
 		 2024 aa  62.4  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.98 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.29 
 
 		 1371 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.95 
 
 		 2927 aa  60.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.38 
 
 		 3562 aa  59.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  29.9 
 
 		 2980 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  43.08 
 
 		 1162 aa  57.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 4429 aa  57  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.29 
 
 		 3542 aa  57  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.06 
 
 		 2402 aa  57  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.09 
 
 		 429 aa  56.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  33.71 
 
 		 1222 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.51 
 
 		 815 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2421 aa  55.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1064 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.96 
 
 		 2454 aa  55.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  30.86 
 
 		 694 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2411 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2367 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  34.02 
 
 		 652 aa  53.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  29.32 
 
 		 4214 aa  53.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.73 
 
 		 2296 aa  53.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.33 
 
 		 2772 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  27.59 
 
 		 750 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1287 aa  53.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  31.96 
 
 		 1466 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.96 
 
 		 2807 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1313 aa  52.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.73 
 
 		 822 aa  51.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 1389 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1066 aa  51.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30.43 
 
 		 799 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.23 
 
 		 5745 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.08 
 
 		 4896 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1245 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.82 
 
 		 2402 aa  50.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3737 aa  50.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  35.11 
 
 		 2848 aa  49.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.59 
 
 		 890 aa  49.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1547 aa  49.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.42 
 
 		 938 aa  48.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  25.16 
 
 		 2064 aa  48.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  34.12 
 
 		 535 aa  48.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  27.78 
 
 		 503 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 1266 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  34.29 
 
 		 1230 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31.63 
 
 		 3602 aa  48.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.89 
 
 		 885 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  39.06 
 
 		 792 aa  48.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  29.73 
 
 		 658 aa  48.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.33 
 
 		 1140 aa  48.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  37.97 
 
 		 2972 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  24.35 
 
 		 886 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1163 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1139 aa  46.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1259 aa  46.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.62 
 
 		 637 aa  46.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  25.25 
 
 		 3471 aa  46.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.25 
 
 		 636 aa  46.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1488 aa  45.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  26.74 
 
 		 496 aa  46.2  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 1606 aa  45.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>