More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13218 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  61.65 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  44.12 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  46.04 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  40.66 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  38.8 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  44.24 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  35.5 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  41.88 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  35.5 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  43.35 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  40.67 
 
 		 203 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  40.88 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  40.88 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  34.9 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  37.91 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  34.04 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  38 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  37.16 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  35.4 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  35.95 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.25 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.25 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.25 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.25 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.25 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.25 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.25 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.22 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.86 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  34.84 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  31.25 
 
 		 571 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  33.96 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  35.26 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.33 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  33.59 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.94 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  27.98 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  34.21 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27.94 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  32.6 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.25 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  40.38 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.91 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  36.91 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  40.38 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30.82 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.47 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  34.07 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  31.61 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  28.22 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  39.42 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  32.09 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  30.68 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  32.88 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.14 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.03 
 
 		 554 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.47 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  27.63 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.91 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  29.55 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.87 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  31.85 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  39.33 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  32.88 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  27.27 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.92 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  35.92 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  38.2 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  38.2 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  38.2 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  38.2 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  33.09 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>