44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13168 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  808  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  45.84 
 
 
393 aa  362  5e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  40.36 
 
 
399 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  40.98 
 
 
396 aa  303  5e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  41.94 
 
 
394 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  38.7 
 
 
408 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  38.52 
 
 
383 aa  239  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 
431 aa  221  2e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  31.89 
 
 
433 aa  216  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  30.65 
 
 
419 aa  196  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  30.11 
 
 
420 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  29.11 
 
 
401 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.98 
 
 
444 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  27.64 
 
 
399 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  28.5 
 
 
402 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  28.4 
 
 
417 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  85.9  1e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  23.12 
 
 
438 aa  72  2e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  23.06 
 
 
418 aa  72  2e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  22.44 
 
 
382 aa  70.1  7e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  21.94 
 
 
407 aa  69.7  9e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  21.71 
 
 
412 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  21.71 
 
 
412 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  21.71 
 
 
369 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  23.12 
 
 
385 aa  67.4  5e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  21.21 
 
 
411 aa  63.5  7e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  21.07 
 
 
372 aa  63.2  8e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  21.05 
 
 
423 aa  62  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  20.43 
 
 
388 aa  61.2  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  22.61 
 
 
412 aa  60.8  4e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  20.72 
 
 
392 aa  60.5  5e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  20.97 
 
 
414 aa  60.5  5e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  23.79 
 
 
403 aa  60.5  6e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  22.33 
 
 
388 aa  60.5  6e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  24.51 
 
 
357 aa  59.3  1e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  17.92 
 
 
399 aa  58.5  2e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25 
 
 
385 aa  57.8  3e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  20.55 
 
 
383 aa  57.8  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  20.63 
 
 
375 aa  55.8  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  21.22 
 
 
416 aa  49.7  9e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  21.41 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  22.7 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  18.8 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>