More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12478 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 
303 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  27.7 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  38.64 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.68 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  37.98 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  24.48 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  30.54 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  36.72 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  25.66 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  28.83 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  25.2 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  26.95 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  35.11 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  26.6 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  37.12 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  26.6 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  24.3 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  26.6 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  26.24 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0733  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  26.69 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  26.69 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  35.59 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  26.42 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  35.59 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  25.89 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  25.91 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  27.17 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  25.17 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.59 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  26.91 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  27.63 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  38.61 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  33.9 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  26.71 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  34.75 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  33.9 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  38.1 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  24.39 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  26.76 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  24.09 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  31.51 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  36 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2093  Prolyl aminopeptidase  27.56 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0430181  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  25.26 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  29.26 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  26.71 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  36.09 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  38.21 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  24.39 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  26.19 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  34.88 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  33.9 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  37.29 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  37.82 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  39.29 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  35 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>