More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12363 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  88.52 
 
 		 246 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  83.27 
 
 		 247 aa  418  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  75.82 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  72.24 
 
 		 245 aa  367  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  72.31 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  69.01 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  69.83 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  68.18 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  62.34 
 
 		 244 aa  317  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  61.83 
 
 		 244 aa  317  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  314  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  314  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  61.6 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.67 
 
 		 241 aa  308  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  59.83 
 
 		 239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  58.58 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  59.24 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.56 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  55.04 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  60.5 
 
 		 249 aa  293  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  60.5 
 
 		 249 aa  293  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.14 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.72 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  56.96 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.14 
 
 		 259 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.46 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  55.27 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.07 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  55.27 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  56.54 
 
 		 263 aa  288  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  57.56 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  56.3 
 
 		 250 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  53.56 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.72 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.98 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  57.32 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  54.43 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  54.43 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  57.39 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.72 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.88 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.27 
 
 		 336 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  52.32 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  55.17 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  55.46 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  55.36 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 246 aa  284  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  56.54 
 
 		 311 aa  284  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  55.27 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  56.61 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  55.7 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.16 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>