232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12238 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  100 
 
 
498 aa  991  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  44.04 
 
 
481 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  47.96 
 
 
494 aa  401  1e-110  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  42.71 
 
 
479 aa  401  1e-110  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  44.42 
 
 
481 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  45.81 
 
 
482 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.69 
 
 
479 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  41.77 
 
 
482 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  43.27 
 
 
482 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  41.77 
 
 
485 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  39.39 
 
 
478 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  41.25 
 
 
483 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.76 
 
 
466 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  42.77 
 
 
476 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  39.64 
 
 
482 aa  357  2e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.47 
 
 
483 aa  352  9e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  41 
 
 
491 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  38.6 
 
 
487 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  38.52 
 
 
485 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.45 
 
 
477 aa  339  6e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  41.05 
 
 
483 aa  338  1e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.55 
 
 
483 aa  337  3e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  40.42 
 
 
483 aa  337  4e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.83 
 
 
482 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  38.31 
 
 
483 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  38.43 
 
 
485 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.83 
 
 
483 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  37.68 
 
 
485 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  39.31 
 
 
485 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  39.23 
 
 
491 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  38.48 
 
 
485 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.67 
 
 
484 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  39.52 
 
 
485 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  39 
 
 
485 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  41.48 
 
 
485 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.13 
 
 
480 aa  322  8e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.82 
 
 
488 aa  322  9e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  36.15 
 
 
524 aa  322  1e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.37 
 
 
488 aa  322  1e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  37.58 
 
 
485 aa  320  4e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  39.04 
 
 
483 aa  320  4e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.62 
 
 
481 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  38.83 
 
 
486 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.47661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  37.22 
 
 
482 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  38.03 
 
 
485 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  39.76 
 
 
483 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  39.29 
 
 
485 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  39.29 
 
 
485 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  39.29 
 
 
485 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  39.29 
 
 
485 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  39.29 
 
 
485 aa  315  1e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  38.62 
 
 
486 aa  315  1e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  39.08 
 
 
485 aa  314  2e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.45 
 
 
488 aa  315  2e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  39.08 
 
 
485 aa  314  2e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  39.09 
 
 
478 aa  314  2e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  38.87 
 
 
485 aa  314  3e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.08 
 
 
485 aa  313  4e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.29 
 
 
483 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  38.83 
 
 
483 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  38.83 
 
 
483 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.71 
 
 
479 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.95 
 
 
485 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.96 
 
 
483 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  38.56 
 
 
484 aa  309  7e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  37.88 
 
 
484 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  38.15 
 
 
483 aa  308  2e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  38.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  38.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  38.68 
 
 
484 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  38.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  39.84 
 
 
483 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  38.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  38.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  38.35 
 
 
483 aa  306  5e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  5e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  36.84 
 
 
510 aa  306  6e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  38.35 
 
 
483 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.63 
 
 
485 aa  305  1e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  39.64 
 
 
483 aa  305  1e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  39.64 
 
 
483 aa  305  1e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.9 
 
 
485 aa  305  2e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  37.83 
 
 
483 aa  305  2e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  38 
 
 
482 aa  303  3e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  39.01 
 
 
512 aa  303  4e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.16 
 
 
488 aa  303  4e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  37.47 
 
 
484 aa  303  6e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  39.8 
 
 
485 aa  302  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  37.55 
 
 
484 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  39.04 
 
 
516 aa  302  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  34.21 
 
 
480 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  38.05 
 
 
483 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.5 
 
 
498 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.96 
 
 
488 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>