More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11988 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  66.44 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  61.36 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  56.38 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  53.02 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  51.33 
 
 		 305 aa  325  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  51.68 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  53.77 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  51.01 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  46.23 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  43.34 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  43 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.55 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  41 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.86 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.67 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.67 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  40.75 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  39.18 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  39.52 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  39.52 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  40.94 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.61 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  37.37 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  37.71 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  39.59 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.04 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.75 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  38.57 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  39.02 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  38.95 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  39.46 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.38 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  37.97 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  38.64 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  39.79 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  39.18 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  41.98 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  38.6 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  40.42 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  38.87 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  36.97 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  37.02 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  38.18 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  38.83 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  37.02 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  37.76 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.29 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  37.92 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  39.12 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  40.14 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  37.68 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  37.09 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  36.88 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.54 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  37.07 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  38.87 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  35.71 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  38.11 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  36.4 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  35.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  37.07 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  37.59 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  36.9 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  40 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  40.87 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.71 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.27 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.27 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  35.49 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.62 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  38.19 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  36.99 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  35.97 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>