68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11968 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  48.95 
 
 
244 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  47.08 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  43.1 
 
 
222 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  43.06 
 
 
222 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  40.59 
 
 
223 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  42.44 
 
 
244 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  41.43 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  41.55 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  36.57 
 
 
228 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  40.43 
 
 
224 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  35.47 
 
 
222 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  37.2 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  37.56 
 
 
223 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  34.42 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  34.42 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  31.1 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  29.33 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  28.37 
 
 
242 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  27.78 
 
 
242 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  27.78 
 
 
242 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.22 
 
 
196 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  31.6 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  30.19 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  26.57 
 
 
217 aa  91.7  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  32.85 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  27.57 
 
 
250 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  27.8 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  28.29 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  25.75 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  39.73 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  27.18 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  28.27 
 
 
672 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  25.96 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  25.69 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  27.5 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  27.72 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  26.15 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  27.86 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  27.64 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  24.64 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  25.98 
 
 
238 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.27 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  25.12 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  23.27 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  22.93 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  24.88 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  33.94 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  25.12 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  25.12 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  25.35 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.79 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  24.77 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  23.44 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  25.47 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  26.52 
 
 
652 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  25.24 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  26.61 
 
 
223 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.1 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  24.38 
 
 
572 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.32 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  24.37 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.8 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  21.78 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  24.29 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  30.36 
 
 
215 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>