43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11638 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  100 
 
 
438 aa  888  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  42.15 
 
 
431 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  40.6 
 
 
422 aa  305  1e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  39.07 
 
 
433 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  38.84 
 
 
417 aa  275  1e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  39.44 
 
 
429 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  39.44 
 
 
422 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  37.1 
 
 
425 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  35.8 
 
 
422 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  38.06 
 
 
421 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  34.4 
 
 
456 aa  213  8e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  31.93 
 
 
451 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  33.26 
 
 
435 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  31.52 
 
 
435 aa  203  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  32.5 
 
 
440 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  32.17 
 
 
428 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  32.43 
 
 
426 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  29.45 
 
 
465 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  29.56 
 
 
394 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  30.73 
 
 
447 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  28.08 
 
 
448 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  27.86 
 
 
448 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  3.40563e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.83 
 
 
459 aa  146  7e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  28.76 
 
 
432 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  28.67 
 
 
456 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  28.72 
 
 
400 aa  122  2e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  25.88 
 
 
405 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  25.51 
 
 
394 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25466e-08 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  24.42 
 
 
388 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  24.67 
 
 
454 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  24.55 
 
 
407 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  22.83 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  22.74 
 
 
380 aa  82.4  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  26.23 
 
 
478 aa  71.6  3e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  29.13 
 
 
458 aa  63.9  5e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  33.06 
 
 
445 aa  60.8  4e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.80978e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  23.94 
 
 
437 aa  59.3  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  34.71 
 
 
449 aa  55.1  2e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  23.48 
 
 
392 aa  54.7  3e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  28.93 
 
 
373 aa  50.8  5e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  22.65 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  24.26 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  24.45 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>