More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11478 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  35.21 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.56 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.88 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.71 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.18 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  32.43 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  30.47 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  29.58 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.63 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 366 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 274 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.38 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  31.96 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  28.64 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.13 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  32.87 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  29.69 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  29.77 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.64 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 270 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  29.26 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.51 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.78 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 318 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.92 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.78 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.48 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.78 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.8 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.96 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.28 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.33 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  31.16 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.22 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.89 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  32.14 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  31.96 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  28.77 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.43 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  32.3 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  28.05 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  28.7 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>