29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11418 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1185    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  24.75 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  26.8 
 
 
633 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  25.25 
 
 
593 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  23.39 
 
 
580 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  23.67 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  28.24 
 
 
742 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
616 aa  114  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  26.67 
 
 
770 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  23 
 
 
673 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  22.14 
 
 
651 aa  110  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  22.04 
 
 
692 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  24.5 
 
 
624 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  20.59 
 
 
638 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  23.92 
 
 
618 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  22.18 
 
 
584 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  23.54 
 
 
624 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  22.86 
 
 
619 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
623 aa  95.1  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  22.12 
 
 
651 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  22.34 
 
 
659 aa  90.5  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  22.29 
 
 
603 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  24.28 
 
 
593 aa  83.6  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  20.78 
 
 
654 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  19.37 
 
 
675 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.17 
 
 
1072 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  25.47 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  23.36 
 
 
867 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  24.78 
 
 
572 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>