217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11333 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  100 
 
 
439 aa  906    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  42.54 
 
 
428 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  42 
 
 
402 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  34.55 
 
 
431 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.32 
 
 
338 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  31.88 
 
 
472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  35.14 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  31.88 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  34.26 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  32.51 
 
 
409 aa  213  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  32.13 
 
 
447 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  30.83 
 
 
448 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  30.66 
 
 
462 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  34.53 
 
 
449 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  31.31 
 
 
423 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  35.46 
 
 
456 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  28.86 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  32.26 
 
 
392 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  30.05 
 
 
450 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  39 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  30.36 
 
 
448 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  32.22 
 
 
444 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  32.68 
 
 
399 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  32.99 
 
 
412 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  31.73 
 
 
419 aa  189  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  32.67 
 
 
444 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.8 
 
 
429 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  30.75 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  31.78 
 
 
413 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  29.75 
 
 
394 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.57 
 
 
433 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.61 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.16 
 
 
412 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  36.07 
 
 
350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  29.23 
 
 
381 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  29.95 
 
 
444 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.38 
 
 
388 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.5 
 
 
415 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.88 
 
 
402 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  29.95 
 
 
412 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.22 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.8 
 
 
311 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.64 
 
 
438 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.56 
 
 
307 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.5 
 
 
363 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  27.16 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
433 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.55 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.58 
 
 
311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.39 
 
 
359 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.41 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  32.11 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.96 
 
 
328 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.15 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.83 
 
 
315 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.49 
 
 
315 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  22.95 
 
 
355 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.46 
 
 
344 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.31 
 
 
345 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.71 
 
 
345 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  22.71 
 
 
355 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  30.2 
 
 
325 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.32 
 
 
342 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.86 
 
 
307 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.76 
 
 
323 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  29.6 
 
 
320 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  23.73 
 
 
355 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  29.73 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  32.05 
 
 
323 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  28.16 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.03 
 
 
320 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4792  periplasmic dipeptidase  45.71 
 
 
102 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.31108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  30.24 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  29.73 
 
 
328 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  30.43 
 
 
323 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  31.89 
 
 
332 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  26.38 
 
 
327 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
323 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
323 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
323 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
323 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  24.85 
 
 
307 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
323 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  22.39 
 
 
393 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
323 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  22.76 
 
 
348 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.39 
 
 
333 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  31.41 
 
 
323 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  32.24 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  22.68 
 
 
311 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  28.02 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>