163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10948 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  100 
 
 		 316 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  73.1 
 
 		 316 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  56.69 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  54.72 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  54.75 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  50.16 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  49.04 
 
 		 311 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  48.23 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  47.14 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  45.83 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  44.44 
 
 		 348 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  43.04 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  42.49 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  46.76 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  35.31 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  32.71 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.81 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  32.82 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  32.51 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  31.86 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  33.57 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.8 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  30.37 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 		 279 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.18 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  29.5 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.84 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  33.65 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.88 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  32.18 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  32.7 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  32.23 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  30.82 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.66 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  32.48 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.38 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.57 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  35.04 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  32.44 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  32.89 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  31.91 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  31.23 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  31.46 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.48 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  31.56 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  31.6 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.5 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.75 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  31.58 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  31.95 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  30.45 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.75 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  30.48 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  28.43 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  28.35 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  29.6 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  29.6 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  29.6 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  29.43 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  30.14 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  30.13 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  28.97 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.1 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  27.86 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  28.84 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.08 
 
 		 355 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  30.08 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  28.3 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  30.65 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.41 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  27.36 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  27.36 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  28.3 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>