More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10468 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 698 aa  713    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  100 
 
 		 700 aa  1449    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.48 
 
 		 704 aa  962    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.92 
 
 		 706 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.98 
 
 		 701 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 		 695 aa  736    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.78 
 
 		 703 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.2 
 
 		 696 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.23 
 
 		 702 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.86 
 
 		 702 aa  1063    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.59 
 
 		 700 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 719 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 712 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 706 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 689 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 772 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 786 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 818 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 		 707 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 		 703 aa  524  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 817 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 819 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 772 aa  522  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.19 
 
 		 767 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 		 779 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 		 679 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.42 
 
 		 717 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 829 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 		 706 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 681 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.38 
 
 		 765 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.19 
 
 		 694 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 		 778 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.03 
 
 		 822 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 827 aa  499  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.59 
 
 		 683 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.54 
 
 		 706 aa  502  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.16 
 
 		 818 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 827 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.72 
 
 		 842 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.03 
 
 		 714 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 682 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.35 
 
 		 818 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 682 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 772 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 688 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 685 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.26 
 
 		 740 aa  492  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 685 aa  489  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 904 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 815 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 		 842 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 691 aa  485  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 763 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 822 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 		 682 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.45 
 
 		 657 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.84 
 
 		 846 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 		 678 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.84 
 
 		 846 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 779 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 781 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 		 671 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 904 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.25 
 
 		 692 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 805 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.29 
 
 		 832 aa  475  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 776 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.17 
 
 		 799 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.52 
 
 		 862 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.02 
 
 		 705 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.52 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 		 691 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 		 691 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 689 aa  463  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.32 
 
 		 776 aa  465  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.91 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 908 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.91 
 
 		 704 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.46 
 
 		 846 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.91 
 
 		 720 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.02 
 
 		 812 aa  459  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.21 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.32 
 
 		 672 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>