19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10348 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  695    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2755  hypothetical protein  56.3 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  30.35 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  29.91 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  30.3 
 
 		 354 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  28.49 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  29.27 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  29.28 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  25.31 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  23.37 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0288  hypothetical protein  27.23 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  22.55 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  27.65 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  24.46 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  24.49 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  26.51 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  25.1 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  23.08 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>