82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10338 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  100 
 
 		 2160 aa  3950    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.52 
 
 		 541 aa  90.1  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  34.49 
 
 		 913 aa  80.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  35.02 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.25 
 
 		 1037 aa  76.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  35.47 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  35.66 
 
 		 459 aa  71.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.9 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.04 
 
 		 2042 aa  70.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  32.5 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  29.26 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  33.19 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 767 aa  68.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  30.72 
 
 		 527 aa  67.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  34.13 
 
 		 435 aa  67  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 575 aa  67  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  35.84 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.56 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.21 
 
 		 361 aa  65.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  31.97 
 
 		 464 aa  64.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  32.76 
 
 		 462 aa  64.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  30.28 
 
 		 459 aa  63.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.49 
 
 		 558 aa  63.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.75 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  31.38 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.62 
 
 		 1296 aa  62.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  32.33 
 
 		 452 aa  61.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26 
 
 		 530 aa  62  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  34 
 
 		 731 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  44.96 
 
 		 817 aa  60.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.56 
 
 		 1197 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  33.11 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  30.85 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  28.12 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.56 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.88 
 
 		 2192 aa  58.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  29.66 
 
 		 665 aa  58.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  29.85 
 
 		 464 aa  58.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.59 
 
 		 468 aa  58.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  33.59 
 
 		 446 aa  57.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  32.65 
 
 		 509 aa  57  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  29.73 
 
 		 466 aa  56.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  29.45 
 
 		 454 aa  56.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  29.82 
 
 		 476 aa  56.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.37 
 
 		 462 aa  56.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  29.33 
 
 		 466 aa  56.2  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  29.82 
 
 		 454 aa  56.2  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  28.83 
 
 		 441 aa  55.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  32.78 
 
 		 467 aa  55.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  28.68 
 
 		 461 aa  55.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.88 
 
 		 481 aa  54.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  30.83 
 
 		 432 aa  54.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.62 
 
 		 601 aa  53.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  27.6 
 
 		 593 aa  53.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1023 aa  53.5  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.05 
 
 		 479 aa  52.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  33.17 
 
 		 518 aa  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 478 aa  52  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  31.25 
 
 		 461 aa  52.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.18 
 
 		 591 aa  51.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  37.08 
 
 		 654 aa  51.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  29.01 
 
 		 532 aa  51.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  33.06 
 
 		 489 aa  50.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  29.62 
 
 		 457 aa  50.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  26.91 
 
 		 483 aa  50.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.65 
 
 		 863 aa  50.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  31.57 
 
 		 362 aa  50.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1061 aa  49.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  30.97 
 
 		 647 aa  49.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  29.01 
 
 		 557 aa  49.3  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  28.52 
 
 		 516 aa  49.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  35.06 
 
 		 852 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  32.67 
 
 		 464 aa  48.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  34.98 
 
 		 476 aa  47.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  29.37 
 
 		 415 aa  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.47 
 
 		 572 aa  47.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5888  cysteine-rich repeat protein  25 
 
 		 709 aa  48.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  28.81 
 
 		 435 aa  47.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  31.09 
 
 		 523 aa  47.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  31.66 
 
 		 460 aa  46.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  33.94 
 
 		 496 aa  45.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  30.67 
 
 		 842 aa  45.8  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>