More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10268 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  45.52 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  48.51 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  48.04 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.98 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  36.43 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.07 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  47.78 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  42.55 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  40.74 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.72 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.72 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.19 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.86 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.07 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.03 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.07 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.78 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.07 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.78 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  45.12 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  45.12 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  39.64 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  42.55 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  32.2 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0700  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.725805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.54 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  36.57 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  38.61 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.07 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.07 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  36.8 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  37.8 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  37.07 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  34.31 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  32.33 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  42.22 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  42.22 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  42.22 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  32.56 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  42.22 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  41.77 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  35.4 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  36.7 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  32.58 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  35.48 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  42.05 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  35.45 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  35.96 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.23 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  32.23 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  42.05 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.91 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  36.43 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  34.43 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.07 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  38.18 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  40.51 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  32.03 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  33.59 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  33.82 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  41.59 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.54 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  32.85 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  36.63 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  35.9 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  41.77 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  36.63 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  36.63 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.04 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  38.74 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  37.84 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  32.23 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>