More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09988 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  58.11 
 
 		 175 aa  180  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 179 aa  141  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  45.99 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  45.26 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 167 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  40.94 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.31 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  38.78 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  39.57 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.4 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  39.57 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  103  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  39.42 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  38.24 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  36.49 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  38.24 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  36.88 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>