More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09768 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  55.56 
 
 		 872 aa  892    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  62.15 
 
 		 793 aa  1031    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  56.99 
 
 		 791 aa  935    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  54.02 
 
 		 790 aa  898    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  100 
 
 		 780 aa  1566    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  44.16 
 
 		 775 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  43.32 
 
 		 814 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  42.62 
 
 		 772 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  41.99 
 
 		 881 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  42.32 
 
 		 787 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 		 775 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  39.95 
 
 		 792 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  39.49 
 
 		 800 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  37.53 
 
 		 923 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 791 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  37.15 
 
 		 803 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  34.75 
 
 		 928 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  35.48 
 
 		 917 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 786 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 		 806 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 789 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 800 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 804 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 852 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 772 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 874 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 875 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 753 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 756 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.58 
 
 		 888 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 831 aa  203  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  22.99 
 
 		 866 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  19.92 
 
 		 906 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  22.24 
 
 		 859 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  32 
 
 		 821 aa  98.6  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  20.76 
 
 		 814 aa  97.4  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 865 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  26.09 
 
 		 791 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  20.44 
 
 		 865 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.4 
 
 		 897 aa  87.8  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  27.07 
 
 		 822 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.82 
 
 		 860 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  27.3 
 
 		 802 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 779 aa  79.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 935 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 771 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  20 
 
 		 859 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 701 aa  74.7  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 797 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  27.98 
 
 		 827 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  24.76 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1089 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  21.07 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1028 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  30.43 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 760 aa  67.8  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 897 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 792 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1056 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 976 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1148 aa  64.3  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1117 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 952 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1104 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 966 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 982 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1040 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 1087 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1075 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1076 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 933 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1117 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1076 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1176 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1023 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.79 
 
 		 1071 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1123 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  27.73 
 
 		 979 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  31.48 
 
 		 972 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1181 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1177 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1047 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 993 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 932 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1115 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>