More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09518 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  455  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  61.64 
 
 
219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  54.59 
 
 
220 aa  251  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  52.75 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  52.91 
 
 
220 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  52.04 
 
 
229 aa  227  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  51.36 
 
 
225 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  47.06 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  46.7 
 
 
238 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.03 
 
 
235 aa  184  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  45.97 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 
253 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.39 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  45.02 
 
 
237 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 
230 aa  177  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  46.15 
 
 
232 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  45.5 
 
 
238 aa  178  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  45.89 
 
 
239 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 
232 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 
232 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  42.27 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.75 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  45.15 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 
228 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  43.69 
 
 
230 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  42.27 
 
 
219 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  44.83 
 
 
228 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.92 
 
 
231 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  37.12 
 
 
225 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  44.12 
 
 
235 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 
233 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  43.69 
 
 
228 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  42.18 
 
 
233 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  42.04 
 
 
236 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  43.84 
 
 
228 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  42.27 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.47 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.65 
 
 
234 aa  165  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  42.92 
 
 
229 aa  165  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  39.45 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  39.45 
 
 
223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  39.61 
 
 
270 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
237 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.05 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.51 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 
229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  42.18 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  41.15 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.8 
 
 
231 aa  161  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  39.61 
 
 
236 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  39.42 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  38.99 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  40.48 
 
 
224 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.13 
 
 
280 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
234 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  40.8 
 
 
202 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  41.43 
 
 
237 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  43.81 
 
 
255 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  40.44 
 
 
229 aa  158  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.42 
 
 
232 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 
237 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  39.23 
 
 
231 aa  157  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.58 
 
 
237 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  40.49 
 
 
233 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  42.38 
 
 
229 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  38.92 
 
 
241 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.78 
 
 
231 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  38.65 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  38.65 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  41.43 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.98 
 
 
232 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 
276 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40 
 
 
241 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  39.41 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40.19 
 
 
234 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 
232 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  37.98 
 
 
268 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 
229 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.19 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  38.16 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  38.54 
 
 
229 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.16 
 
 
229 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  39.61 
 
 
232 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  39.61 
 
 
232 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  39.61 
 
 
242 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  38.07 
 
 
213 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.86 
 
 
235 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  40.1 
 
 
202 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.42 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  38.79 
 
 
241 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40.3 
 
 
227 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.92 
 
 
262 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.55 
 
 
226 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  36.89 
 
 
275 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.38 
 
 
233 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
244 aa  148  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.46 
 
 
234 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  40.1 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.39 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>