More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09408 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  50.36 
 
 		 281 aa  288  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  44.37 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  47.89 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  45.42 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  41.54 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  41.9 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  41.7 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  40.67 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  45.25 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.31 
 
 		 304 aa  175  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  38.54 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  42.25 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  43.78 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.68 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.65 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.57 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  35.57 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  40 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  37.55 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  35.11 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.94 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  37.55 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  37.3 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  34.92 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.54 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.41 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.35 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  37.39 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.47 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.76 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.4 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  35.71 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  35.55 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.47 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  35.69 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.57 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.86 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.93 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  38.84 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  32.88 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  34.42 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  37.17 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.51 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.87 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.42 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.38 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  32.13 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  36.28 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.71 
 
 		 359 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.13 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  36.68 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.58 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  36.84 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  38.43 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  33.86 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  34.01 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.18 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  35.45 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  35.32 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  35.77 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.48 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  34.4 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.47 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  32.56 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.07 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  35.07 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.48 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  31.08 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.32 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  36.82 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.92 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  34.92 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.61 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.92 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  34.92 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.1 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  34.78 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  34.12 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  32.56 
 
 		 587 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  32.56 
 
 		 587 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.52 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.21 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.22 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  37.89 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.71 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>