More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09353 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09353  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  100 
 
 
372 aa  759    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170333  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.46 
 
 
625 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.24 
 
 
581 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2850  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.65 
 
 
444 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3115  inducible ATP-independent RNA helicase  48.64 
 
 
457 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0086  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.07 
 
 
604 aa  350  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.389821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.84 
 
 
634 aa  339  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08811  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  45.56 
 
 
623 aa  333  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.93 
 
 
584 aa  332  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.47 
 
 
546 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.2 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  42.94 
 
 
531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.9 
 
 
536 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 
541 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.89 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.42 
 
 
657 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.46 
 
 
565 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.49 
 
 
643 aa  309  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
539 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.64 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.46 
 
 
590 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.21 
 
 
511 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.49 
 
 
466 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.58 
 
 
527 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.78 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.21 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  43.21 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  43.21 
 
 
528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.21 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.21 
 
 
528 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.21 
 
 
525 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  43.21 
 
 
533 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.21 
 
 
525 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.66 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  42.94 
 
 
529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  42.78 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
531 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.3 
 
 
528 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
532 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
538 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.21 
 
 
589 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
467 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
550 aa  299  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  42.86 
 
 
527 aa  298  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.81 
 
 
634 aa  298  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.69 
 
 
513 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  40.39 
 
 
656 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.5 
 
 
530 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.11 
 
 
614 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.44 
 
 
405 aa  296  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.39 
 
 
623 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.11 
 
 
637 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  42.74 
 
 
579 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.83 
 
 
589 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  44.54 
 
 
551 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.54 
 
 
623 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  43.58 
 
 
513 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.97 
 
 
506 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.97 
 
 
506 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.96 
 
 
527 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.67 
 
 
509 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.83 
 
 
605 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.3 
 
 
498 aa  292  5e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.06 
 
 
541 aa  292  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.97 
 
 
602 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
640 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.44 
 
 
611 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.72 
 
 
610 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 
640 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.73 
 
 
640 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.73 
 
 
640 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.17 
 
 
599 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.73 
 
 
640 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.27 
 
 
619 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.61 
 
 
908 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.67 
 
 
581 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.46 
 
 
527 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
485 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
485 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.27 
 
 
622 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2144  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.42 
 
 
560 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.616746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.44 
 
 
607 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
529 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.08 
 
 
514 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.94 
 
 
583 aa  289  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.2 
 
 
507 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
622 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.94 
 
 
530 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  42.08 
 
 
574 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.22 
 
 
669 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
532 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.17 
 
 
550 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  41.5 
 
 
563 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.78 
 
 
653 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  42.33 
 
 
460 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.56 
 
 
482 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.67 
 
 
528 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.67 
 
 
528 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
595 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.84 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>