37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09318 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  100 
 
 		 939 aa  1896    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.03 
 
 		 909 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.15 
 
 		 1010 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2039  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1002 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  26.4 
 
 		 457 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  27.79 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  27.32 
 
 		 450 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.43 
 
 		 1056 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  26.98 
 
 		 458 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  26.8 
 
 		 458 aa  94.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4674  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1002 aa  91.3  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.597863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 448 aa  88.6  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  26.03 
 
 		 442 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  26.53 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  28.89 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 427 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1022  hypothetical protein  20.32 
 
 		 1089 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  22.1 
 
 		 803 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  26.64 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  25.38 
 
 		 441 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  28.89 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0505  hypothetical protein  21.27 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  23.66 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.93 
 
 		 1075 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  23.3 
 
 		 610 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  23.75 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  23.58 
 
 		 575 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  24.93 
 
 		 453 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  25.46 
 
 		 591 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  24.32 
 
 		 666 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 463 aa  44.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>