More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09173 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  100 
 
 		 457 aa  912    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  55.73 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  52.07 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  39.28 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  40.8 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  39.24 
 
 		 454 aa  309  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  37.99 
 
 		 442 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  38.7 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  33.74 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  30.65 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  31.34 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  30.65 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  33.03 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  34.6 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  31.47 
 
 		 461 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  31.59 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  34.38 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  30.09 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.26 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  29.95 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.96 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  32.49 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  29.54 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  29.96 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 483 aa  206  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  31.47 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  31.08 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.24 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  30.86 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.24 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  30.43 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.73 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.73 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  30.2 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.51 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.51 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.2 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  30.63 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  30.63 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  30.63 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  30.63 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  30.63 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  30.63 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  30.26 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2037  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01185  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  30.26 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 457 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 470 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 459 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  30.2 
 
 		 457 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  30 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  30 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  30 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29.62 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  30.41 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.8 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  31.4 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>