More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09061 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  100 
 
 		 538 aa  1113    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  46.98 
 
 		 544 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  42.72 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 544 aa  232  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  31.42 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.07 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.42 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 540 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  25.47 
 
 		 586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  25.47 
 
 		 586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.54 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.41 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.81 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.89 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.01 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  25.65 
 
 		 526 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  25.05 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 531 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.1 
 
 		 531 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.4 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 532 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.56 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 519 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.28 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  24.54 
 
 		 541 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1303  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.173146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.33 
 
 		 545 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 549 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4375  4-phytase  22.59 
 
 		 525 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 545 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  23.63 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  23.63 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  23.63 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  23.63 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  25.65 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 503 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 535 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.42 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 506 aa  143  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.48 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5283  periplasmic dipeptide-binding protein, putative  23.97 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.46 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.13 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.22 
 
 		 525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 529 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.47 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.8 
 
 		 524 aa  140  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>