122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09001 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  163  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  49.32 
 
 
101 aa  80.1  9e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
111 aa  79  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  47.95 
 
 
107 aa  75.5  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  53.42 
 
 
100 aa  72.8  1e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  47.89 
 
 
115 aa  72.4  2e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  45.83 
 
 
95 aa  71.2  4e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  48.57 
 
 
95 aa  71.6  4e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 
95 aa  71.2  5e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  50.65 
 
 
97 aa  70.9  5e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 
119 aa  70.9  6e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  47.89 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  47.22 
 
 
96 aa  70.1  1e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.95 
 
 
100 aa  68.9  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  46.05 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  48.57 
 
 
100 aa  68.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  47.95 
 
 
95 aa  68.9  2e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  43.84 
 
 
95 aa  68.6  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  41.77 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 
98 aa  67  8e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  43.84 
 
 
95 aa  67  9e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  44.44 
 
 
96 aa  66.6  1e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  44.44 
 
 
96 aa  66.6  1e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  46.48 
 
 
95 aa  66.2  1e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 
113 aa  65.9  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  40.28 
 
 
102 aa  65.5  2e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  40.28 
 
 
109 aa  65.5  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  45.07 
 
 
102 aa  64.7  4e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  41.89 
 
 
107 aa  64.3  5e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 
99 aa  64.3  5e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 
120 aa  63.9  6e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  42.47 
 
 
95 aa  63.9  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 
130 aa  63.9  7e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 
95 aa  63.9  8e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 
96 aa  63.9  8e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 
96 aa  63.5  8e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.47 
 
 
95 aa  63.5  9e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 
110 aa  63.5  1e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  50.72 
 
 
95 aa  63.5  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.36 
 
 
95 aa  63.2  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 
96 aa  62.4  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  42.11 
 
 
101 aa  62.4  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 
95 aa  62  3e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  35 
 
 
121 aa  60.8  5e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 
114 aa  61.2  5e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 
95 aa  61.2  5e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  41.43 
 
 
104 aa  60.5  7e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 
95 aa  60.5  8e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.54 
 
 
95 aa  60.5  8e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  46.48 
 
 
107 aa  60.1  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.07 
 
 
97 aa  59.7  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  42.03 
 
 
98 aa  58.9  2e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 
100 aa  58.5  3e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 
95 aa  57.4  6e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  45.21 
 
 
83 aa  56.6  1e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 
98 aa  56.2  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 
125 aa  55.8  2e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 
118 aa  55.1  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 
118 aa  55.1  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 
118 aa  55.1  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 
99 aa  53.1  1e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  35.94 
 
 
141 aa  53.1  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 
95 aa  53.5  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 
101 aa  53.1  1e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
108 aa  52.4  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 
95 aa  51.2  4e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
98 aa  51.2  5e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.54 
 
 
96 aa  50.4  7e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 
95 aa  50.4  8e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  36.84 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 
82 aa  50.1  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  36.84 
 
 
97 aa  50.1  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 
82 aa  50.1  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.13 
 
 
99 aa  50.1  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.49 
 
 
80 aa  48.9  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.16284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.14 
 
 
90 aa  48.9  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  38.03 
 
 
90 aa  48.5  3e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  36.99 
 
 
338 aa  48.5  3e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.66383e-11  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  48.5  3e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  47.8  5e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.5 
 
 
87 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 
113 aa  47.8  5e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.51 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.86 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.43 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.48 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  44 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  36.11 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.47 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.78 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.81458e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>