More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08771 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  76.87 
 
 
152 aa  241  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  71.33 
 
 
165 aa  226  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  59.12 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  57.64 
 
 
164 aa  177  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  57.89 
 
 
165 aa  168  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  54.68 
 
 
174 aa  167  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  53.79 
 
 
176 aa  164  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.21 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  34.27 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  36.13 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  40.2 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.3 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 
176 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  32.06 
 
 
143 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  32.58 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  36.13 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  34.15 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  33.33 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  32.06 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  32.59 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  35.9 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  32.77 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  25.78 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  31.09 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 
168 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  37.07 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  32.8 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  31.45 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  35.45 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  30.25 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  32 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  31.09 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  32.48 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  28.08 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  32.48 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  34.35 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  34.19 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  31.2 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.47 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.77 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  33.88 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.54 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  31.82 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  34.19 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  33.62 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  31.5 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  29.91 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  31.5 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  30.77 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.15 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  25.34 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  32.62 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  33.88 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  32.76 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.98 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  34.48 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>