180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08721 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 440 aa  867    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  52.28 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  48.85 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  49.41 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  45.05 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  45.05 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  45.79 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  45.27 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  45.05 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  45.05 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  45.25 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  44.39 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  46.35 
 
 		 415 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  46.19 
 
 		 425 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  45.25 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  45.02 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  44.2 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  46.33 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  44.96 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  45.14 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  43.91 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  42.72 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  46.47 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  44.59 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  44.6 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  46.17 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  46.17 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  44.95 
 
 		 421 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  45.71 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  46.26 
 
 		 407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  44.83 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  44.6 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  44.93 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  43.89 
 
 		 410 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  44.85 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  44.08 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  43.58 
 
 		 427 aa  322  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  43.47 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  45.33 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  45.86 
 
 		 413 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.03 
 
 		 428 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  41.34 
 
 		 403 aa  293  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  36.7 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  36.7 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  39.24 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  41.23 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  39.2 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  41.88 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  36.29 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  39.34 
 
 		 468 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  37.02 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  35.88 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  36.41 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  39.63 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  34.99 
 
 		 431 aa  245  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  35.14 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  34.36 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  34.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  34.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  34.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  34.14 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  34.57 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  33.85 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  33.85 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  33.85 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  33.85 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  33.85 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.96 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  33.88 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  32.74 
 
 		 434 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  32.49 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  32.96 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  33.48 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  33.71 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  32.08 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  33.64 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  33.86 
 
 		 399 aa  206  9e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  31.81 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  29.17 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  29.17 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.91 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  34.17 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.94 
 
 		 457 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  28.94 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  30.39 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.7 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  30.07 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  30.8 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  32.27 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  30.1 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  29.89 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.87 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  29.91 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  30.47 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>