More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08061 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  837    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  64.69 
 
 		 407 aa  552  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.8 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  33.82 
 
 		 542 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 662 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 653 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  45.9 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.37 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  47.93 
 
 		 226 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  41.49 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  44.27 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  50 
 
 		 506 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  30.15 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.74 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  45.71 
 
 		 253 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  41.08 
 
 		 240 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  45.71 
 
 		 253 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  39.68 
 
 		 306 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.08 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.96 
 
 		 321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  45 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.75 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 249 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  43.1 
 
 		 238 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  42.53 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 1309 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  38.01 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  43.37 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 878 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  41.95 
 
 		 249 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.24 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 890 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 640 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  41.28 
 
 		 797 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.12 
 
 		 603 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.99 
 
 		 323 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  42.46 
 
 		 251 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.67 
 
 		 743 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5440  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 407 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235159  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.86 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  38.82 
 
 		 874 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.01 
 
 		 624 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 1224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 680 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 323 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  42.24 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 749 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  39.2 
 
 		 363 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.91 
 
 		 743 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 829 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 729 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  35.04 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.14 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  42.24 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1144 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.71 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.71 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.23 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 952 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.72 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 831 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  41.1 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  33.76 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  39.75 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.88 
 
 		 669 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.74 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 897 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 929 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  30.64 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  40.11 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 635 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  42.95 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  30.64 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  40.99 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 1002 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.62 
 
 		 599 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  40.37 
 
 		 323 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 864 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 500 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  36.76 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 941 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.13 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>