More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07921 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  47.34 
 
 
296 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.95 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  35.83 
 
 
282 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  51.64 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
281 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
277 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  48.72 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 
296 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  50.82 
 
 
252 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
267 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
260 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
260 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 
277 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
475 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
341 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  40.46 
 
 
712 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
261 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
263 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
287 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
295 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  44.35 
 
 
303 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
263 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
282 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  46.36 
 
 
280 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
295 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
278 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
264 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
242 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 
306 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
271 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
272 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
280 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
280 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 
254 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  48.28 
 
 
282 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44.25 
 
 
249 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
262 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
267 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.41 
 
 
285 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.03 
 
 
264 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
281 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
283 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
269 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
258 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
285 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.25 
 
 
285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.67 
 
 
256 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  37.25 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  42.86 
 
 
264 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  32.3 
 
 
274 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>