More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
379 aa  767    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  50.78 
 
 
652 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.06 
 
 
355 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
705 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
298 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
308 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
311 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
306 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
313 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
290 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
333 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
310 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
313 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
340 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
294 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
714 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
336 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
317 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
317 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
311 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.84 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
305 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
318 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
841 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
318 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
334 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
296 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
296 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
296 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.76 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
304 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
361 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
312 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
310 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
358 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
318 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
290 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
305 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  28.47 
 
 
297 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
346 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
334 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.2 
 
 
297 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
369 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.63 
 
 
301 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
340 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
248 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
342 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
298 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
314 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
841 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
312 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3552  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139728  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
1739 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30.8 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
282 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
624 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.7 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
336 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
288 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
308 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
1340 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
902 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
679 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
345 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>