More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07110 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  100 
 
 
303 aa  609  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  70.53 
 
 
302 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  65.15 
 
 
310 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  51.01 
 
 
306 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  49.21 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  47.14 
 
 
296 aa  273  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  50.73 
 
 
305 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  47.76 
 
 
304 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  47.96 
 
 
311 aa  255  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  44.44 
 
 
289 aa  245  6e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  45.08 
 
 
298 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  43.04 
 
 
317 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  42.61 
 
 
295 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  39.8 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  43.29 
 
 
294 aa  215  9e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  43 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.12 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  40.14 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  40.13 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.8 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.8 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  39.8 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  39.12 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  39.12 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.53 
 
 
286 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  41.64 
 
 
296 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.14 
 
 
283 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.12 
 
 
283 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  41.08 
 
 
286 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  41.08 
 
 
286 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  39.24 
 
 
295 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.46 
 
 
283 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  42.09 
 
 
298 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.25 
 
 
287 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40.55 
 
 
289 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  42.18 
 
 
283 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  39.8 
 
 
283 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  38.89 
 
 
295 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.89 
 
 
310 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.64 
 
 
283 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  38.41 
 
 
297 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  42.67 
 
 
295 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  40.2 
 
 
305 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  38.41 
 
 
297 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  38.41 
 
 
305 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  39.52 
 
 
290 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  42.95 
 
 
303 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  38.41 
 
 
305 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.8 
 
 
289 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  38.54 
 
 
295 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  38.78 
 
 
288 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  38.78 
 
 
290 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.85 
 
 
295 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  41.83 
 
 
256 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  39.86 
 
 
290 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  38.83 
 
 
290 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.93 
 
 
294 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  39.44 
 
 
298 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  41.43 
 
 
256 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  36.65 
 
 
328 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  36.94 
 
 
323 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.07 
 
 
304 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.1 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  41.6 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  41.18 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  37.62 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  40.91 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.38 
 
 
288 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  38.24 
 
 
303 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  38.28 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  37.46 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  39.02 
 
 
303 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.73 
 
 
255 aa  198  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  37.87 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.21 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  39.37 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39.02 
 
 
298 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  38.74 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  36.21 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  39.52 
 
 
290 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  40.13 
 
 
299 aa  195  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  40.21 
 
 
287 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.25 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  36.75 
 
 
306 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  38.7 
 
 
377 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  38.49 
 
 
286 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  37.76 
 
 
294 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  36.18 
 
 
285 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.18 
 
 
290 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  38.75 
 
 
297 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.46 
 
 
295 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  40.15 
 
 
335 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>