More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06945 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  100 
 
 
145 aa  293  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 
153 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 
170 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 
153 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 
170 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  34.59 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
170 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
153 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
173 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
153 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
149 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
144 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
151 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
149 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
151 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  35.51 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 
159 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 
158 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
173 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.32 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
165 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
149 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  37.12 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
152 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.91 
 
 
187 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  36.36 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
160 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
163 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
163 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
174 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
144 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
150 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
162 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
154 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
160 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
150 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
150 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
159 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 
148 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
150 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 
164 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
150 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
150 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  28.36 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  28.36 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>