More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06440 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  100 
 
 
127 aa  256  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  42.06 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  42.65 
 
 
134 aa  85.5  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  37.72 
 
 
229 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.78 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  46.74 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  40.4 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  33.03 
 
 
685 aa  69.3  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  39.32 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  42.25 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.63 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  36.26 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  30 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  35.43 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
278 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  42.68 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  33.61 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.11 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  38.1 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  32.56 
 
 
288 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  38.64 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  37.36 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  38.27 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 
550 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 
387 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  36.17 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
282 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 
470 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
466 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.09 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  42.86 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
244 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  33.73 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.71 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
459 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  30.25 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  29.7 
 
 
198 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
272 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  35.23 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  27.93 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  45.21 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 
284 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>