123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06260 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  922    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  50.11 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  46.44 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  33.92 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  31.15 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  27.58 
 
 		 651 aa  196  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  29.75 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  29.47 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  28.72 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  26.67 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 481 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.67 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 442 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  20.82 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  29.91 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  30.33 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  30.33 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 792 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 1061 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  35.63 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  22.45 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.91 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.23 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.62 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 355 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 372 aa  53.5  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 360 aa  53.5  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.35 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  24.6 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.12 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  35.05 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  29.46 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 359 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  30.68 
 
 		 366 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 370 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  23.17 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  31.71 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  28.03 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  34.85 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  31.31 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.58 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  32.05 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  20.45 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  26.02 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  22.69 
 
 		 414 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  25.88 
 
 		 396 aa  47.4  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  26.45 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  24.74 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.53 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.54 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  26.79 
 
 		 367 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  31.33 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.7 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  26.53 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  32.89 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  31.18 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  30.77 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.75 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  20.49 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  23.02 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>