43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06200 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06200  YurI  100 
 
 		 657 aa  1323    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  36.05 
 
 		 388 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  36.26 
 
 		 256 aa  134  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  35.02 
 
 		 542 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  35.11 
 
 		 275 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  33.97 
 
 		 275 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  35.29 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  35.29 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  35.55 
 
 		 553 aa  125  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  34.51 
 
 		 275 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  33.1 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  34.24 
 
 		 558 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  33.73 
 
 		 539 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  33.85 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  29.16 
 
 		 365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  31.27 
 
 		 267 aa  117  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.08 
 
 		 1346 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  29.58 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  34.22 
 
 		 1310 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  31.51 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  27.64 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  28.52 
 
 		 539 aa  90.9  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  30.53 
 
 		 1503 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  28.22 
 
 		 285 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  26.09 
 
 		 614 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  28.04 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  33.33 
 
 		 272 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5943  Disintegrin  36.61 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  31.36 
 
 		 516 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  27.04 
 
 		 314 aa  70.1  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  30.14 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  28.9 
 
 		 232 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  29.83 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  37.97 
 
 		 219 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  35.21 
 
 		 1441 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  33.33 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  29.19 
 
 		 311 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  35.44 
 
 		 211 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.63 
 
 		 669 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  34.67 
 
 		 461 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  31.46 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.57 
 
 		 4214 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  40.82 
 
 		 356 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>