More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05820 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  100 
 
 
447 aa  885    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  74.16 
 
 
447 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  74.55 
 
 
448 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  56.82 
 
 
444 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  53.17 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  54.83 
 
 
446 aa  456  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  55.21 
 
 
447 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  54.75 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  52.6 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  50.68 
 
 
440 aa  435  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  51.24 
 
 
435 aa  432  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  49.1 
 
 
443 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  47.97 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 
443 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
441 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  47.3 
 
 
443 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  48.2 
 
 
443 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.27 
 
 
500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.15 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.31 
 
 
435 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.41 
 
 
420 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.52 
 
 
442 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  40.95 
 
 
437 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
435 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
424 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 
445 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  40.59 
 
 
435 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.74 
 
 
448 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 
454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.57 
 
 
445 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.43 
 
 
447 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
447 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 
435 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 
418 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
446 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 
445 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
446 aa  316  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  40.27 
 
 
435 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 
446 aa  315  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  43.64 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  42.18 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  41.7 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
421 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 
435 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  42.54 
 
 
429 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 
456 aa  312  6.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
446 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.22 
 
 
419 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 
446 aa  312  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 
435 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  42.11 
 
 
448 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.71 
 
 
448 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
446 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.59 
 
 
426 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.25 
 
 
446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 
435 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.18 
 
 
437 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 
457 aa  310  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 
441 aa  309  8e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.71 
 
 
443 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 
446 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.71 
 
 
443 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 
421 aa  308  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.52 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 
443 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.7 
 
 
443 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  42.53 
 
 
452 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.27 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.77 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.19 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41 
 
 
447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  40.78 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 
437 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  41.47 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  40.37 
 
 
431 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  40.95 
 
 
444 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 
447 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  39.91 
 
 
423 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  40.33 
 
 
442 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>