297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05810 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 60 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 58 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 60 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 57 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 57 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  60 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  56.9 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000247564  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  61.11 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  51.85 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  55.17 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  52.73 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>