More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05750 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  84.67 
 
 		 139 aa  244  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0390  50S ribosomal protein L16  80.71 
 
 		 141 aa  233  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  75.91 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  75.18 
 
 		 143 aa  213  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 140 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 140 aa  203  6e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  69.5 
 
 		 144 aa  201  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  65.22 
 
 		 139 aa  190  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  65.94 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  61.03 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  62.68 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0592  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0289  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1686  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000414216  hitchhiker  0.000000385308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  63.77 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 141 aa  180  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1723  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.936678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0368  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0766  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436008  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2527  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.16 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  60.9 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 160 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 160 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  177  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2302  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.102886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0866  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  61.43 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  59.42 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0591  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146592  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3908  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000657151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2743  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.059862  normal  0.198129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0967  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104122  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  65.15 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0290  50S ribosomal protein L16  63.91 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000162666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  62.32 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0496  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  62.12 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4537  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159558  hitchhiker  0.00171467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  60.99 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  62.88 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0573  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 179 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>