More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05710 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
101 aa  201  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  95.96 
 
 
103 aa  191  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  92.08 
 
 
101 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  90.1 
 
 
101 aa  187  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  87 
 
 
101 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  85.15 
 
 
101 aa  179  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 
101 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 
101 aa  175  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  84.16 
 
 
101 aa  174  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  81 
 
 
101 aa  169  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  75 
 
 
102 aa  163  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  66 
 
 
102 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  146  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  63 
 
 
102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  140  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  68.37 
 
 
103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  66 
 
 
103 aa  138  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
104 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  60.61 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  63 
 
 
102 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
102 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
105 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
104 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
106 aa  135  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
106 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
102 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  57.58 
 
 
102 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
104 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
104 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
105 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
105 aa  134  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 
101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
105 aa  133  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
106 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2297  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
102 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238807  hitchhiker  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  133  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  57 
 
 
102 aa  133  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>