54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  30.86 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  26.82 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  26.82 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  26.82 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  26.82 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  28.31 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  28.85 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  28.11 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  27.17 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  28.32 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  27.75 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  28.65 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  25 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25.27 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  25.43 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  28.65 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  28.18 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.71 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.86 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  26.04 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  25.14 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25.57 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  24.29 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  24.18 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  26.51 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  24.73 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  27.88 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.17 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  25.93 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  22.53 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  24.44 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  22.53 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  22.53 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  24.59 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  23.08 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  22.99 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  22.42 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  28.25 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  21.55 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  30.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  25.15 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  21.98 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  24.71 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>